(이하는 여전히 네타바레 만재 : 라서 접어둡니다)">-요정전쟁의 전말-

전쟁은 장기화하고 지상은 피폐해져 인간도 레프리로이드도 한계에 가까워져 가는 가운데,
극도의 인간지상주의자인 닥터 바일은 [오메가]와 [다크 엘프]를 사용한 전쟁의 조기 종료안을 내놓는다.
궁극의 전투병기 [오메가]를 제작해 이레귤러화한 레프리로이드는 물론 이레귤러화할 가능성이 있는
모든 레프리로이드를 처분하며, [마더 엘프]를 개조해 사이버 엘프와 레프리로이드들을 자유롭게 조작하는
[다크 엘프]로 만들어 오메가를 서포트하는 것. 이로 인한 일련의 사태는 후에 [요정전쟁]으로 불리게 된다.
오메가에 의한 무차별 레프리로이드 학살과 다크 엘프가 일으키는 이레귤러끼리의 난전으로 오메가 투입 후
단 4년만에 전쟁은 종결국면에 들어서지만, 그 대가는 전 인류의 60%와 레프리로이드 90%의 사멸이었다.
결국 엑스와 제로에 의한 오메가의 봉인이라는 형태로 요정전쟁은 종료되었고, 인간들은 이 최악의 결과가
같은 인간의 손에 의해 일어났다는 사실을 은폐하기 위해 요정전쟁에 관한 모든 자료를 기능정지한 오메가와
함께 위성궤도에 폐기된 유폐용 우주선에 봉인한다. 바일은 [사형조차 과분한 사상 최악의 전범]으로서,
인격 이식 기술을 이용해 그 몸을 레프리로이드화한 뒤 자기수리복원기능이 내장된 아머 케이스에 가두어
죽음도 허락되지 않는 채 황폐해진 멸망의 사막으로 추방당한다. 얼마간의 전후 처리가 끝난 뒤
다크 엘프의 회수에 성공한 엑스는 자신의 몸을 키로서 다크 엘프를 봉인하며 무기한의 동면에 들어간다.
그리고, 남겨진 사람들의 약한 마음들이 엉키는 가운데 네오 알카디아의 강압통치체제가 서서히 구축되었다-